RDKit
RDKit — набор программных библиотек с открытым исходным кодом для обработки и анализа молекулярных структур. Позволяет исследователям преобразовывать записи структур между форматами, рассчитывать характеристики молекул, искать заданные фрагменты и формировать числовые признаки для машинного обучения.
проверено по: rdkit.org ↗
См. также
- PubChemPubChem — общедоступная база химической информации Национальных институтов здравоохранения США для учёных, студентов и широкой публики. Объединяет сведения из разных источников о структурах и свойствах веществ, их биологической активности и токсичности, а также ссылки на научные публикации и патенты.
- ChEMBLОткрытая база данных биологически активных молекул с лекарственноподобными свойствами. Её курирует вручную и поддерживает Европейский институт биоинформатики (EMBL-EBI). В ней собраны химические структуры соединений и измеренные показатели их активности по отношению к биологическим мишеням — константы связывания, фармакологические и токсикологические данные. Данные взяты из публикаций по медицинской химии и результатов скрининга. Базой пользуются химики и биологи при поиске лекарств, а разработчики ИИ — для обучения и проверки моделей.
- Медицинская химияНаучная дисциплина на стыке химии, биологии, медицины и фармакологии (medicinal chemistry): занимается поиском, созданием и оптимизацией молекул будущих лекарств и других биологически активных соединений. Изучает, как строение вещества связано с его действием (зависимость «структура — активность»), а также как вещество действует на молекулярном уровне и как превращается в организме. Этим занимаются химики в фармацевтических компаниях и научных лабораториях, которые разрабатывают лекарства.
В новостях
Google добавила в Antigravity навыки химика для разработки лекарств
Открытая библиотека для работы с химическими данными: считает свойства молекул, переводит записи структур из одного формата в другой и ищет совпадения подструктур.