Google DeepMind, Meta* и власти США вложатся в открытые данные о клетках

Проект Virtual Biology Initiative, который собирает открытые данные о клетках человека для обучения ИИ, вырос до 1,8 млрд долларов: к нему присоединились Google DeepMind, Isomorphic Labs, Meta и два ведомства США. Демис Хассабис, глава Google DeepMind и Isomorphic Labs, отозвался на это в соцсети X: «Самое важное, к чему мы можем применить ИИ, — улучшение медицины и здоровья людей».

Почему это важно: модели, которые должны предсказывать поведение клетки, упираются в данные. Как объясняла при запуске проекта Присцилла Чан, большая часть биологических данных разрознена, закрыта и собрана под один конкретный вопрос. Biohub называет вклады участников самым крупным совместным вложением в биологические данные для ИИ.

Предыстория: 29 апреля проект запустила Biohub — исследовательская организация Присциллы Чан и Марка Цукерберга. Она пообещала вложить в него 500 млн долларов за пять лет. Тогда к ней присоединились институты Броуда, Аллена и Сенгера, Arc Institute и NVIDIA, которая помогает с вычислениями.

В цифрах: вот из чего складываются 1,8 млрд долларов:

• Biohub вносит 500 млн: 400 млн — на свои технологии измерений и сбор данных, 100 млн — на гранты внешним лабораториям.
• Министерство энергетики США даст больше 500 млн за пять лет через программу Genesis Mission¹: суперкомпьютеры, криоэлектронная томография², рентгеновские и нейтронные установки, автономные лаборатории.
• Google DeepMind, Isomorphic Labs и Meta вместе вкладывают 300 млн долларов в технологии измерений и наборы данных разного типа.
• Национальные институты здравоохранения США³ вносят не деньги, а уже собранные данные: на них раньше ушло больше 500 млн федеральных средств, Biohub приведёт их к единому формату для обучения моделей.

Детали: цель проекта — «виртуальная клетка», то есть программа, которая предсказывает, что будет с клеткой от лекарства, мутации или болезни. Для этого нужно измерить, как клетки отвечают на такие вмешательства, причём на гораздо большем числе типов клеток и условий, чем изучали до сих пор. «Точная предсказательная модель биологии могла бы резко ускорить научные открытия, позволив учёным ставить эксперименты в цифровом виде», — считает руководитель науки Biohub Алекс Райвс.

Как это работает: данные будут открыты всем исследователям. Наборы данных получат общие стандарты, единые идентификаторы и одну точку доступа, которой управляет Biohub. У Biohub уже есть похожие открытые базы: CELLxGENE с данными об отдельных клетках и CryoET Data Portal со снимками клеток, сделанными криоэлектронным микроскопом.

Между строк: Isomorphic Labs — выделенная из DeepMind компания Alphabet, которая сама ищет лекарства с помощью ИИ. Её президент Макс Ядерберг (Max Jaderberg) объясняет участие масштабом задачи: «Данные для предсказательной системной биологии требуют масштаба, который сегодня не по силам ни одной отдельной организации».

Но: 1,8 млрд долларов — не только новые деньги. Свои 500 млн Biohub пообещала ещё в апреле, а NIH вносит данные, оплаченные прежде. Новые обязательства октября — больше 800 млн долларов от Министерства энергетики и трёх компаний. Самой виртуальной клетки пока нет: проект только собирает для неё данные.