Claude за четыре недели ускорил в среднем вчетверо 30 открытых моделей для биологии
Claude ускорил более 30 открытых моделей для биологии: в среднем они работают вчетверо быстрее. Крупные белковые комплексы теперь считаются на одном узле с GPU. Anthropic выложила код и вместе с Adaptyv Bio объявила конкурс по дизайну белков.
Открытые модели, которыми биологи предсказывают структуру белков, проектируют лекарственные молекулы и оценивают эффект мутаций, теперь работают в среднем в четыре раза быстрее. Их ускорил Claude — за неполные четыре недели. Anthropic рассказала об этом в своём научном блоге и выложила весь код оптимизаций в открытый доступ. В посте в X компания объясняет задачу так: специализированные модели дороги в запуске, и это может ограничивать их пользу.
Работу вела внутренняя исследовательская модель общего назначения в среде Claude Science. Присматривали за ней два сотрудника Anthropic, которые разбираются в биомолекулярном моделировании, но раньше не оптимизировали инференс и не писали ядра для GPU. Claude написал набор ядер FlashPairformer, то есть низкоуровневых программ для видеокарты. Они ускоряют две самые дорогие операции в моделях вроде AlphaFold3 и Boltz-2. По данным компании, по этим операциям FlashPairformer в 1,7–3,2 раза обгоняет стандартные решения. Если чуть пожертвовать точностью, ускорение достигает четырёх раз, а при полностью идентичных результатах — почти двух.
Кроме того, Claude сделал режим экономии памяти Big. Раньше крупные молекулярные машины приходилось считать сразу на нескольких узлах с GPU, теперь хватает одного. Так удалось точно предсказать структуру митохондриального комплекса I и бактериальной рибосомы — это больше 10 000 токенов каждая. Система запускалась и на вирусных капсидах до 70 000 токенов, но такие структуры она уже предсказывает неверно.
Подешевел и дизайн белков-связывателей. В прошлой кампании Claude мог тратить до 10 000 долларов на одну мишень. Теперь у каждой модели была одна видеокарта H200, сутки времени и запрос примерно на 1 100 слов. Mythos 5.1, Mythos 5 и Opus 5 получили примерно такие же оценки в компьютерной проверке. GPU и токены обошлись примерно в 150 долларов.
Вместе с Adaptyv Bio компания запускает конкурс по дизайну белков из пяти сложных задач. Больше 5 000 присланных конструкций проверят в лаборатории. Anthropic выделит до 1 млн долларов в кредитах на Claude, Modal — до 250 000 долларов на вычисления, Twist Bioscience предоставит ДНК. Anthropic считает, что передовые модели помогут учёным быстрее создавать научные инструменты. Проверить это можно будет по тому, как сообщество воспользуется выложенным кодом.